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轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
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mRNA測(cè)序
產(chǎn)品介紹
結(jié)果展示
送樣建議
文獻(xiàn)案例
  • 產(chǎn)品描述

    mRNA是在蛋白質(zhì)合成時(shí)充當(dāng)模板的RNA。mRNA-seq是為檢測(cè)mRNA表達(dá)發(fā)展出來(lái)的高通量測(cè)序技術(shù)。其技術(shù)原理,是對(duì)RNA中含有polyA尾的mRNA用oligo dT進(jìn)行富集。進(jìn)而對(duì)富集下來(lái)的mRNA進(jìn)行片測(cè)序。進(jìn)而對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行生物信息學(xué)分析,從而獲得RNA中的基因表達(dá)、可變剪接、RNA編輯等信息。

    產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
    1、通量高、敏感性高的技術(shù),對(duì)于多基因分析及低頻突變檢測(cè)具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)
    2、全基因組分析,無(wú)需預(yù)先設(shè)計(jì)特異性探針能夠檢測(cè)未知基因
    3、低成本,高準(zhǔn)確性,大幅降低了測(cè)序時(shí)間
    4、數(shù)字化信號(hào),直接測(cè)定每個(gè)轉(zhuǎn)錄本片段序列,單核苷酸分辨率的精確度
    5、利用高深度的測(cè)序數(shù)據(jù)組裝構(gòu)建轉(zhuǎn)錄本序列,識(shí)別可變剪接模式
    實(shí)驗(yàn)流程


     
  • 數(shù)據(jù)分析



  •  

    樣本類(lèi)型建議送樣量存儲(chǔ)介質(zhì)保存、運(yùn)輸條件
    組織>50mg1.RNA later;
    2.存入凍存管;
    3.大塊組織樣本不建議放入trizol保存;
    4.1.5ml無(wú)菌離心管
    -80℃保存,干冰運(yùn)輸
    細(xì)胞>2 x 10^61.收集的細(xì)胞沉淀,加入1ml trizol震蕩混勻-80度保存;
    2.收集的細(xì)胞沉淀,液氮速凍5-10min,-80℃冰箱保存;
    -80℃保存,干冰運(yùn)輸
    全血>1mlA.采用EDTA抗凝管采血,禁用肝素抗凝管,新鮮血液效果更佳。
    B.或者分離出PBMC加 trizol 混勻。
    C.或者全血離心去掉血漿加 trizol 混勻。
    D.或者使用PAXgene Blood RNA Tube靜脈真空采血管(全血RNA管)
    PS:請(qǐng)盡量不使用RNA later保存全血。
    -80℃保存,干冰/4度(新鮮)運(yùn)輸
    FFPEA.切片組織面積大于1cm2,切片表面無(wú)劃痕,無(wú)干裂,均勻貼片的石蠟切片;
    B.切片組織細(xì)胞>30000個(gè);有核細(xì)胞比例>80%;腫瘤細(xì)胞比例>20%,白片厚度5~ 10um,需3-5片,組織面積偏小或細(xì)胞核占比未達(dá)80%以上,需提供5-12片;

    C.石蠟塊:厚度4mm以上,組織約綠豆大小以上;
    D.蠟卷:厚度25um左右,2-5卷
    /4℃或常溫保存和運(yùn)輸
    RNA>1ugDEPC水;Water Nuclease-Free-80℃保存,干冰運(yùn)輸
  • 研究方向/思路

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