1. 空間位置標(biāo)記 Visium HD的空間基因表達(dá)芯片有2個(gè)捕獲區(qū)。每個(gè)捕獲區(qū)域?yàn)?.5x6.5mm。捕獲區(qū)有~1100萬(wàn)個(gè)基因表達(dá)spot點(diǎn)，每個(gè)點(diǎn)包括標(biāo)記空間位置的Spatial Barcode，以追溯RNA來(lái)源位置信息。

2. 全基因組探針捕獲 同單細(xì)胞Fixed RNA方案，Visium HD空轉(zhuǎn)也使用全基因組探針靶向雜交捕獲的方式，探針由左右臂組成，只有左右臂同時(shí)靶定目的區(qū)域才能進(jìn)行連接被膠珠上的Poly(dT)VN捕獲。

基于以上兩點(diǎn)，單鏈連接產(chǎn)物在RNase處理和透化后從組織中釋放出來(lái)，然后在空轉(zhuǎn)載玻片上被捕獲。一旦連接產(chǎn)物被捕獲，探針經(jīng)過(guò)延伸后被添加上UMI、Spatial Barcode和Read1T。最終生成帶有空間條形碼的探針產(chǎn)物，繼續(xù)用于測(cè)序文庫(kù)的制備。

注意事項(xiàng) 暫時(shí)僅可支持人和小鼠，若需要做其他物種，可聯(lián)系我們做新鮮速凍組織空轉(zhuǎn)（一代）。